Un écrasement d’ONVI survient dans la forêt de l’Oregon. Le shérif Miles prévient Ray, son adjoint, de l’attendre. À l'endroit où Mulder a tracé une croix sur le sol 7 ans plus tôt, tout le système électrique de la voiture de Miles est hors de contrôle et fonce droit sur la voiture de Ray. Le shérif se relève et s’avance vers la voiture de Ray. Une substance verte et toxique garnie le sol. Le shérif se tourne et voit «Ray».
Après une séance chez le comptable, Mulder rejoint Scully à son bureau. Ils reçoivent un appel de Billy Miles : tout recommence, mais pas avec lui cette fois. Billy regarde son père. Les agents se rendent en Oregon où ils revoient Billy. Il raconte ce qui est arrivé : un OVNI s'est écrasé, mais il n'a pas été retrouvé. Ray a aussi disparu. Sur le lieu de l'écrasement, on retrouve de l'asphalte brûlé et des cartouches de balles. Le shérif les prend et les met dans le coffre arrière de sa voiture. Nous découvrons qu'il cache le corps de son adjoint.
Dans une prison en Tunisie, Marita vient chercher Alex Krycek. Ils se rendent près de l’Homme à la cigarette qui est maintenant mourant. Krycek a pour mission de retrouver le vaisseau. Mais après plusieurs recherches, Krycek ne le trouve pas.
En Oregon, le soir, deux adolescents, Gary et Richie se rendent dans la forêt. Gary est secoué dans les airs lorsqu'il vient près du champ d'énergie. Il se fait enlever. Pendant ce temps, Richie tient une lampe de poche dans ses mains. Elle prend feu lorsqu'elle éclaire le champ d'énergie. Richie crie le nom de Gary, mais jamais il ne répond.
Mulder et Scully rendent visite à la femme de Ray, Teresa Hoese. Elle leur donne le dossier médical de Ray. Le soir venu, elle se fait enlever. Dans la chambre, les agents retrouvent le tapis brûlé par la substance verte laissée par les extraterrestres. À l'extérieur, Mulder observe un adolescent très nerveux, Richie. Mulder s'approche. Richie clame que son ami, Gary a disparu. Il les amène dans les bois. Mulder suit Richie qui veut lui montrer sa lampe de poche. Scully, quant à elle, regarde de son côté. Elle est secouée dans les airs, mais elle n'entre pas dans le champ d'énergie. Mulder la retrouve couchée sur le sol et très confuse. Il la prend dans ses bras. D'après lui, les enlèvements ne sont pas fait au hasard. Ils enlèvent ceux qui ont déjà été enlevés.
En retournant chez lui, Billy trouve que son père est bizarre. Il prend son revolver et le menace. Le shérif réussit à dissuader son fils de laisser tomber son arme. Billy s'assoit, il est ébranlé. La transformation se fait, c'est le mercenaire.
Mulder revient au FBI. Skinner entre dans son bureau, mais il est accompagné de Marita et Krycek qui ont des informations importantes pour lui : le vaisseau est réellement dans la forêt, malgré ce que pense Mulder, il est seulement recouvert par un champ d’énergie. Bientôt, les preuves des anciens enlèvements seront effacées par les mercenaires. En réunion, tout le monde, incluant les Lones Gunmens, essaie de trouver une stratégie pour récupérer le vaisseau. Scully en a assez, elle sort de la pièce. Elle est suivie par Mulder qui déclare qu'il ne veut pas qu'elle se rende en Oregon de nouveau parce qu'elle sera enlevée. Il ne veut pas la perdre. Scully le prend dans ses bras. Elle ne le laissera pas y aller seul.
Il y va avec Skinner. Mulder essaie de trouver le champ magnétique en mettant des faisceaux de lumière rouge. Quand le champ commence, les faisceaux s'arrêtent. Mulder met sa main dans le champ d'énergie, elle est secouée, mais il entre à l'intérieur. Il retrouve Billy, Teresa et Ray. Il se fait enlever. Skinner est témoin de cet enlèvement, il voit le vaisseau partir. Lorsqu'il vient annoncer la nouvelle à Scully à l'hôpital, elle le sait déjà. Skinner promet de jamais nier ce qu'il a vu. Il pleure. Scully et Skinner se mettent d'accord, il faut retrouver Mulder. Scully lui annonce une grande nouvelle, elle est enceinte